Signal enrichment with strain-level resolution in metagenomes using topological data analysis
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
pattern recognition in maintenance data using methodologies data minitng (cade study isfahan regional power electric company)
فعالیت های نگهداری و تعمیرات اطلاعاتی را تولید می کند که می تواند در تعیین زمان های بیکاری و ارایه یک برنامه زمان بندی شده یا تعیین هشدارهای خرابی به پرسنل نگهداری و تعمیرات کمک کند. وقتی که مقدار داده های تولید شده زیاد باشند، فهم بین متغیرها بسیار مشکل می شوند. این پایان نامه به کاربردی از داده کاوی برای کاوش پایگاه های داده چندبعدی در حوزه نگهداری و تعمیرات، برای پیدا کردن خرابی هایی که موجب...
15 صفحه اولStrain/species identification in metagenomes using genome-specific markers
Shotgun metagenome sequencing has become a fast, cheap and high-throughput technology for characterizing microbial communities in complex environments and human body sites. However, accurate identification of microorganisms at the strain/species level remains extremely challenging. We present a novel k-mer-based approach, termed GSMer, that identifies genome-specific markers (GSMs) from current...
متن کاملdesign of an analog ram (aram)chip with 10-bit resolution and low-power for signal processing in 0/5m cmos process
برای پردازش سیگنال آنالوگ در شبکه های عصبی ، معمولا نیاز به یک واحد حافظه آنالوگ احساس میشود که بدون احتیاج به a/d وd/a بتواند بطور قابل انعطاف و مطمئن اطلاعات آنالوگ را در خود ذخیره کند. این واحد حافظه باید دارای دقت کافی ، سرعت بالا ، توان تلفاتی کم و سایز کوچک باشد و همچنین اطلاعات را برای زمان کافی در خود نگهدارد. برای پیاده سازی سیستمی که همه این قابلیتها را در خود داشته باشد، کوشش...
15 صفحه اولStatistical topological data analysis using persistence landscapes
We define a new topological summary for data that we call the persistence landscape. In contrast to the standard topological summaries, the barcode and the persistence diagram, it is easy to combine with statistical analysis, and its associated computations are much faster. This summary obeys a Strong Law of Large Numbers and a Central Limit Theorem. Under certain finiteness conditions, this al...
متن کاملEstimating Most Productive Scale Size with Double Frontiers in Data Envelopment Analysis using Negative Data
In this paper, it is assumed that the “Decision Making Units“( ) are consist of positive and negative input and output. Firstly, the optimistic and pessimistic models have been suggested by using negative data and then units with most productive scale size are measured in optimistic and pessimistic models. These productive values are compared with double frontiers and Hurwicz’s Criterion to obt...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: BMC Genomics
سال: 2019
ISSN: 1471-2164
DOI: 10.1186/s12864-019-5490-y